Melanóza označuje stav, kdy se melanin nachází kdekoliv v prostatické tkáni (v glandulární či stromální složce). V prostatě byl popsán modrý névus (stromální depozice melaninu) a glandulární melanóza tvořená depozicí melaninu v epitelové složce.
Lipofuscin se rovněž nachází u řady afekcí prostaty, zahrnující škálu od benigní hyperplázie, přes PIN až k prostatickému adenokarcinomu. Je nutné se uvědomit, že ne pouze semenné váčky obsahují cytoplasmatický pigment, což je důležité např. při stanovení stagingu PAK.
